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opentrons-integration

Opentrons官方协议API，专为OT-2和Flex机器人设计。适用于编写针对Opentrons硬件的协议，全面支持Protocol API v2功能。最适合生产环境中的Opentrons协议，确保官方API兼容性。若需多厂商自动化或更广泛的设备控制，请使用pylabrobot。

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@K-Dense-AI

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Opentrons 集成 - 实验室自动化液体处理机器人

技能概述


Opentrons 集成提供官方 Protocol API v2 支持，帮助你在 Python 中编写自动化液体处理协议，控制 Flex 和 OT-2 机器人完成移液、PCR 设置、连续稀释等实验室操作。

适用场景

  • 编写 Opentrons 自动化协议：使用 Python 编写 Protocol API v2 协议，在 Flex 或 OT-2 机器人上执行液体处理、样品转移和复杂的多步骤实验流程

  • 硬件模块集成控制：协调温度模块、磁力模块、热混器和热循环仪等硬件设备，实现需要精确温控或磁珠分离的自动化实验

  • 高通量液体处理：执行96孔板复制、连续稀释、PCR体系构建等批量操作，减少手动操作误差，提升实验通量

    • 核心功能

  • 液体处理操作：支持基础移液（aspirate/dispense）、transfer、distribute、consolidate 等操作，以及混合、气隙、吹出等高级技巧，可精确控制流速和体积

  • 硬件模块控制：提供温度模块（设定/等待温度）、磁力模块（磁珠分离）、热混器（温控+振荡）、热循环仪（PCR程序）等模块的完整 API 控制

  • 实验室器皿管理：支持加载各种类型的移液头、培养板、储液槽和适配器，可通过 wells()、rows()、columns() 等方法灵活访问孔位

    • 常见问题

    Opentrons 集成和 pylabrobot 有什么区别？


    Opentrons 集成是官方 Protocol API，专为 Opentrons 硬件（Flex、OT-2）设计，提供完整的 API v2 功能支持，最适合生产环境中的 Opentrons 协议开发。pylabrobot 则是多供应商自动化框架，适合需要同时控制不同品牌设备的场景。

    如何开始编写第一个 Opentrons 协议？


    首先安装 opentrons 包，然后创建包含 metadata 和 run() 函数的 Python 文件。在 run() 函数中使用 protocol_context 加载仪器、器皿和模块，编写液体处理命令。建议先在仿真模式（opentrons_simulate）下测试协议，确认无误后再在实际机器人上运行。

    Opentrons 支持哪些类型的液体处理操作？


    支持基础操作（aspirate、dispense、pick_up_tip、drop_tip）、批量操作（transfer、distribute、consolidate）、高级技巧（mix、air_gap、blow_out、touch_tip）以及流速控制。使用多通道移液器时，可以整列操作，显著提升96孔板处理效率。