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代谢组学工作台数据库 (Metabolomics Workbench Database)

技能概述

通过 REST API 访问 NIH 资助的 Metabolomics Workbench，获取 4,200+ 代谢组学研究数据，支持代谢物查询、质谱数据搜索和生物标志物发现。

适用场景

1. 代谢组学研究数据获取

研究人员可以通过该技能快速检索和下载公开的代谢组学研究数据，包括实验条件、分析结果和元数据，适用于文献数据验证、二次分析和跨研究比较。

2. 代谢物鉴定与命名标准化

使用 RefMet 数据库将代谢物名称标准化，通过 m/z 值、化学式或 InChI Key 精确匹配代谢物，解决不同数据库命名不一致的问题，提高数据整合效率。

3. 质谱数据分析与化合物识别

针对 LC-MS、GC-MS 和 NMR 平台产生的质谱数据，通过 m/z 搜索功能快速识别候选化合物，支持多种离子加合类型和质量容差设置。

核心功能

1. 代谢物结构与信息查询

支持通过多种标识符（PubChem CID、InChI Key、KEGG ID、HMDB ID 等）检索代谢物信息，可下载分子结构（MOL/PNG 格式），获取化合物分类和跨数据库交叉引用。

2. 研究数据与元数据访问

提供按代谢物、研究机构、研究者或疾病类型筛选研究的功能，可获取研究摘要、实验因子、分析方法和完整的实验数据（支持 JSON 和 TXT 格式）。

3. 质谱 m/z 搜索

支持通过质荷比（m/z）值搜索化合物，可指定离子加合类型（M+H、M-H、M+Na 等）和质量容差，在 Metabolomics Workbench、LIPIDS 和 RefMet 数据库中查找匹配项。

常见问题

Metabolomics Workbench 是什么？

这是由 NIH Common Fund 资助、UCSD 托管的国家级代谢组学数据仓库，收录了超过 4,200 个处理过的代谢组学研究（其中 3,790+ 个公开可用），提供标准化的代谢物命名系统和强大的搜索功能。

如何使用这个 API 技能？

该技能提供 REST API 访问接口。你可以通过发送 HTTP 请求到特定端点来获取数据，例如查询化合物信息、搜索研究或执行 m/z 搜索。API 返回 JSON 或 TXT 格式数据，支持编程集成和自动化数据获取。

数据访问是否免费？

是的，Metabolomics Workbench 是公开的学术资源，所有数据和研究结果均可免费访问。API 调用没有认证要求，但建议合理使用并缓存常用参考数据以减少请求频率。